仁济医院建于1844年，是上海开埠后第一所西医医院。

医院目前由东西南北四个院区和上海市肿瘤研究所组成，是一个学科门类齐全，集医疗、教学、科研于一体的综合性三级甲等医院：东院位于浦东陆家嘴金融贸易区内，于1999年10月建成投入使用，占地86875m2，建筑面积206859m2；西院位于黄浦区中央商务区内，毗邻外滩，占地7811m2，建筑面积31959m2；南院位于闵行区浦江镇，紧邻世博家园，于2012年12月建成投入使用，占地68497m2，建筑面积82590m2；北院位于巨野路灵山路，占地6667m2，建筑面积17350m2，于2013年7月全面启用；肿瘤所位于斜土路，总建筑面积7523m2，由癌基因与相关基因国家重点实验室、肿瘤流行病学研究室、十三个相关的研究课题组、辅助部门公共服务平台与《肿瘤》杂志编辑部组成，于2010年10月与仁济医院正式“院所合一”。

医院东、西、北三个院区目前总核定床位1650张，南院核定床位600张。

截止2013年底，医院共有在编职工2511人（不含南院），其中正、副高级职称专家328名；博导57名、硕导148名，门急诊量342万人次，手术6.39万例，出院人数8.47万人，平均住院日为7.9日，医院设有50个临床医技科室：消化科、心内科、血液科、风湿病科、老年病科、呼吸科、肾脏科、神经内科、内分泌科、肿瘤科、肿瘤介入科、康复科、急诊科、核医学科、放射诊疗科、泌尿科、胃肠外科、胆胰外科、乳腺外科、骨科、心血管外科、胸外科、血管外科、神经外科、功能神经科、肝脏外科、整形外科、麻醉科、中医科、儿科、眼科、妇产科、妇科肿瘤科、生殖医学科、五官科、头颈外科、皮肤科、感染科、口腔科、营养科、放射科、超声医学科、病理科、检验科、药剂科、输血科、内科门诊、健康管理中心、变态反应科、重症医学科。

近年来，医院申请到的科研项目及专利逐年递增，包括国家级的973计划、863计划、国家自然基金（重大、重点）项目等，其中2013年科研经费达1.48亿元。

医院还获得多项国家科技进步奖、中华医学科技奖、高等学校科技进步奖等；先后共有几百人次入围各级人才培养计划，包括973首席科学家、长江特聘教授、卫生部有突出贡献中青年专家、国家杰出青年、上海市领军人才等。

医院与美国、加拿大、法国、比利时、德国等近十个国家的二十多所医学院校建立了学术交流和友好合作关系。