1949年新中国成立，1950年沙湾县医疗卫生机构随着人民政权的建立，卫生事业逐步发展，到1955年成立了沙湾县文教卫生科，2月，沙湾县人民卫生院成立，并设有医疗、卫生防疫、妇幼保健等科室。

共有工作人员9人，其中技术人员7人。

1956年，沙湾县开始在社队筹建医疗所与卫生所，并建立了公私合营联合诊所，设病床24张。

1958年，全县医疗机构7处，工作人员36人，其中卫生技术人员32人；1962年，全县医疗卫生机构增至20个，有医疗卫生人员89人，病床70张。

其中县人民医院44人，病床55张，7个人民公社卫生院，有卫生人员21人，14个大队有卫生人员24人；企事业内设卫生所7个，卫生人员9人；1966年，大队开始开展合作医疗试点，全县医疗卫生人员增至224人，其中生产队医疗卫生人员94人，民族医疗卫生人员由50年代的空白发展到20人。

1971年，根据毛泽东主席"六·二六"指示精神，沙湾县制定《沙湾县合作医疗实施方案》，在沙湾县全面实行合作医疗，发展赤脚医生，至1976年，全县有赤脚医生440人，90%以上的大队实行了合作医疗。

沙湾县县、社、队三级医疗卫生网基本建立，农牧区缺医少药的状况基本得到改善。

1978年，中共十一届三中全会以后，沙湾县卫生事业也步入了改革的潮流之中，开始审批个体行医和进行医疗部门承包责任制的试点。

1980年，县、社两级医院共有病床449张，年门诊人次达174365人次，病床平均占有日为54180人次。

1985年，全县有医疗单位52个，卫生技术人员339人，其中个体行医2家；1990年，全县有乡镇卫生院14个，农牧场卫生所4个，企事业内设卫生所8个，村级医疗点156个（其中个体137个），共有专业技术人员396人，其中少数民族91人，卫生专业技术人员312人。

沙湾县中医院设病床150张，有职工193人，其中卫生技术人员140人，副高级职称2人，中级职称25人，医院门诊量达到100890人次，住院3641人次，可开展上腹部、下腹部等复杂手术，骨外科技术达到地区先进水平。

1991-1995年，我县完成了各乡镇卫生院的"一无三配套"工程，先后盖起了乌兰乌苏镇、四道河子镇、金沟河镇、东湾镇、大泉乡、柳毛湾镇、安集海镇卫生院门诊楼、老沙湾镇、博尔通古乡、商户地乡卫生院的门诊及病房。

我县对乡镇卫生院"一无三配套"工程的建设，获得自治区级先进单位称号。

1992年成立了沙湾县中医院，卫生医疗机构不断壮大，为更好地把我县卫生事业发展向前推进，县委、政府十分重视，于1996年4月成立了卫生局党委。

在卫生局党委的领导下，卫生系统各族干部能以中央7号文件和自治区党委5号文件精神狠抓卫生防疫、妇幼保健、爱国卫生等工作，使各类传染病下降为41.93/10万，结核病防治全面完成地区下达的任务并获地区先进单位，食品卫生监督三次通过了伊犁州、自治区人大、自治区爱卫会检查验收，同时被评为自治区级改厕先进县、爱国卫生先进集体，最佳卫生县城等荣誉称号。

红十字会自独立设置以来，积极开展辖区志愿者宣传教育活动，先后举办医疗救护培训班2期300余人次，确定采血16个，采血431人，采血量为130200毫升，有利地推动了我县红十字会事业的发展。

2000年，医疗体制向市场化方向转移。

县财政加大对乡镇医疗机构的投入，稳定了乡镇医疗队伍，全县共有专业技术人员819人，其中卫生专业技术人员645人，设病床555张，为开展农牧区合作医疗奠定了基础。

2004年，沙湾县被自治区确定为新型农牧区合作医疗试点县。

2005年新型农牧区合作医疗工作在我县全面推行，农牧民参合率达83.4%。

2006年被确定为国家级新型农牧区合作医疗试点县后，农牧民参合率达92.4%。

截止2006年，共有县直医疗卫生单位4家，即县人民医院、疾病预防控制中心、妇幼保健院、温泉医院；乡镇卫生院12家，民营医疗机构5家，村卫生室169家，个体医疗机构50余家。

各级各类医疗机构中拥有专业技术人员1043人（包括乡村医生和个体医疗机构从业人员），其中卫生技术人员816人，副高职称17人，中级职称122人，卫生技术人员中，90%以上为中专以上学历。

县人民医院作为我县唯一一家集医疗、科研、急救、康复、培训等工作为一体的二级甲等医院综合医院，拥有万元以上医疗设备50余台、件，各种类型的中小型设备装备齐全，在北疆县级医院中名列前茅，与自治区人民医院结成技术协作单位，实行药剂科托管，降低了医药费，有效解决"看成病贵、年病难"问题。

人对医院综合满意度达97%；疾病预防控制中心与县卫生局卫生监督所于2004年底正式分设，疾控中心做为我县的疾病预防控制机构，在全县的传染病、地方病、职业病、结核病防治和计划免疫等工作方面，取得了优异的成绩，疫情报告网络畅通。

003年被地区卫生局评为"防非"先进单位、2005年被自治区卫生厅为鼠疫监测先进单位；卫生监督所担负着全县的食品卫生、公共场所卫生、医疗机构等的监督检查任务，自分设以来，积极开展各项工作，使各项工作逐步走向正规；妇幼保健院承担着全县妇女、儿童保健、婚前医学检查等工作，在短短的几年内，取得了一定的成绩，各项工作走上了规范化，并积极创造条件开展人性化服务，努力为妇女儿童创造良好的保健就医环境，并于2006年争取到中加妇幼项目在我县落户。

温泉医院是新疆境内以水疗为主的专科医院之一，泉水中含有20余种对人体有益和促进人体健康的矿物质和微量元素，其水质雄居全国三大热水泉之首。

它是集疗养、旅游、康复、理疗、水疗于一体的社会福利性卫生事业单位。

2005-2006年我县积极争取到中央国债乡镇卫生院建设项目补助资金320万元，新建了406平方米的博尔通古乡卫生院、872平方米的四道河子镇卫生院门诊部、398平方米的西戈壁镇门诊部、406平方米的商户地乡卫生院门诊部和230平方米的三个泉子牧民定居点卫生所门诊部，250平方米博尔通古牧场卫生院、921平方米柳毛湾镇卫生院门诊部，并对其余乡镇卫生院进行维修改造工程，现已全部完工，投入使用。